Η επιλογή των σημαντικών ειδών χλωρίδας του Νομού Χανίων ξεκίνησε με τον εντοπισμό των φυτών που ανήκουν σε μία ή περισσότερες από τις παρακάτω κατηγορίες:
- Ενδημικά Ελλάδας
- Φυτά Περιορισμένης Εξάπλωσης
- Φυτά τοπικής ευθύνης
- Φυτά για τα οποία έχει αξιολογηθεί η Κατάσταση Διατήρησής τους
- Φυτά που περιλαμβάνονται σε κάποιο ειδικό καθεστώς προστασίας:
- Προεδρικό Διάταγμα 67/1981
- Οδηγία των Οικοτόπων (Οδηγία 92/43/ΕΟΚ)
- Σύμβαση της Βέρνης (1982)
Προέκυψε κατάλογος σημαντικών φυτών που εντοπίζονται στο Ν. Χανίων.